Результаты работы с Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1

Тип макромолекулы: белок (фермент).

В структуре присутствует одна полимерная цепь (цепь A).

В одну биологическую единицу входит одна цепь А.

Рис. 1. Структура тирозин-протеинфосфатазы.

Организм: Homo sapiens

UniprotID: P18031

Название белка: Тирозин-протеинфосфатаза

Функции белка:

  1. Опосредует дефосфорилирование EIF2AK3/PERK; инактивирует активность протеинкиназы EIF2AK3/PERK.
  2. Может играть важную роль в каскадах передачи сигналов, индуцируемых CKII и p60c-src.
  3. Может регулировать сигнальный путь EFNA5-EPHA3, который модулирует реорганизацию клеток и межклеточное отталкивание.
  4. Может также регулировать сигнальный путь рецептора фактора роста гепатоцитов посредством дефосфорилирования MET.

Мутации были обнаружены.

Модифицированных оснований обнаружено не было.

В записи присутствуют:

  1. HOH - вода (растворитель).
  2. TRS - 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL (широко используется в качестве буферного раствора)
  3. JGD - N,N-dimethylpyridin-4-amine (кактализатор ацилирования аминов)

Белок состоит из одной полимерной цепи.

Рис. 2. Тирозин-протеинфосфатаза

Белок имеет альфа-спирали и бета-листы примерно в равном соотношении.

Рис. 3. Соотношение разных типов вторичных структур.

Рис. 4. Аминокислотные остатки белка на расстоянии до 5 ангстрем от молекулы TRS.

Рис. 5. Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка.

Рис. 6. Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот.

Рис. 7. Солевой мостик между ARG-56 и ASP-65.

Рис. 8. Дисульфидные связи отсутствуют, желтым цветом обозначены цистеины.

Рис. 9. Стекинг между TRP-125 и HIS-173.